وقعت السنغال وغينيا بيساو عددا من اتفاقيات التعاون العسكرية الثنائية، حول تبادل المعلومات والدوريات المشتركة على طول الحدود، فضلا عن تكوين الضباط البيساو غينيين في داكار.
وعلى هامش التوقيع الذي تم في بيساو، تباحث قائد أركان الجيش السنغالي الجنرال الشيخ واد مع نظيره البيساو غيني الجنرال باغي نا نتان، حول تعزيز التعاون العسكري بين البلدين.
وكانت علاقات البلدين تعاني دائما من التوتر بسبب اتهام السينغال لغينيا بيساو أنها تدعم المتمردين في كانزمانص، وقد كانت غينيا بيساو هي عراب أتفاق السلام الأخير الموقع بين حكومة السينغال، ومتمردي كازمانص.
وتتوف السينغال من الناحية العسكرية على غينيا بيساو،وغينيا كوناكري، حسب المعهد الدولي للدراسات الاستراتيجية في لندن.
